Центральное место в работе КСТП занимает комплекс вопросов, связанных с перевозками контейнерных грузов по Транссибу в повседневном и перспективном плане, с привлечением грузов на Транссибирский маршрут, с реализацией перевозочного потенциала Транссиба.